В августе 1581 Делагарди вместе с адмиралом Флемингом по Финскому заливу и реке Нарове на кораблях прибыл к крепости Нарва и обложив её с трёх сторон, начал готовиться к штурму. Перед его началом Делагарди объявил своим войскам, что на приступ пойдут лишь те, кто заранее запишется у него, все же остальные будут лишены права участвовать в разграблении города, на которое им отводилось 24 часа.

6 сентября Нарва была взята, и за следующие сутки шведами было убито около 7 тыс. человек мирного населения, не считая русских стрельцов из гарнизона крепости...

5 ноября 1585 во время переправы через реку Нарову выстрелила пушка Нарвской крепости, приветствуя Понтуса Делагарди. В ответ на её приветствие выстрелила пушка судна на котором находился Делагарди. От этого выстрела лодка развалилась и затонула, потопив всю команду.

Полководец был похоронен в Домском соборе Ревеля, рядом со своей женой, умершей при родах в 1583 году. Работу над надгробием четы Делагарди фламандским скульптор Арент Пассер начал только в 1589, а закончил в 1595. На крышке саркофага он поместил фигуры супругов, вырубленные из камня: слева — Понтуса, в военном облачении, справа — Софии, в наряде по испанской моде того времени. По бокам были расположены барельефы, один из которых изображал осаду Нарвы. Это первое известное изображение города.